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Genomica Funzionale

La Metapontum Agrobios ha in itinere progetti di ricerca che hanno come obiettivo finale lo sviluppo e la selezione di nuove linee di pomodoro (Lycopersicon esculentum) con specifici caratteri di interesse agronomico-nutrizionale. Per il raggiungimento di tale obiettivo si sta impiegando la tecnologia del TILLING (Targeting Induced Local Lesions In Genomes).
Il TILLING è un sistema di “reverse genetic” che associa alla mutagenesi chimica tecniche sofisticate di biologia molecolare per individuare la/e mutazione/i puntiforme/i e quindi l’allelle o la serie allelica del gene responsabile del carattere di interesse. Poiché la mutagenesi chimica (es. EMS) è facilmente applicabile e l’identificazione della mutazione di interesse dipende dalla conoscenza della sequenza nucleotidica del gene in esame, il TILLING è stato utilizzato con successo in molti organismi sia essi vegetali (Arabidopsis thaliana, pomodoro, lattuga, frumento, mais, Lotus japonicus) che animali (zebrafish, drosophila) indipendentemente dalle dimensioni del loro genoma.
Il TILLING possiede tre principali caratteristiche: primo, esso non richiede trasformazioni genetiche; secondo, può essere automatizzato in un sistema di high throughput e terzo, esso consente l’identificazione di mutazioni non solo “nonsense” (knockout) ma anche di mutazioni “missense”.
Attualmente, presso la Metapontum Agrobios, si dispone di due popolazioni mutagenizzate di pomodoro da industria (cultivar Red Setter) prodotte mediante trattamento dei semi con due diverse concentrazioni dell’agente mutageno EMS (0.7% e 1% EMS). Le due popolazioni (7000 famiglie M2) verranno utilizzate per l’identificazione e l’analisi di nuove linee di pomodoro nell’ambito di progetti di ricerca sia nazionali (ITALYCO, MIUR) che internazionali (progetto europeo EU-SOL, FP6).

LycoTILL: Tomato Mutant Database

Info: Dott.ssa Filomena Carriero